山海鲸可视化

曼哈顿图(Manhattan Plot)

山海鲸可视化,提供一站式数字孪生解决方案,致力于打造一款人人都会用的,零代码数字孪生工具。

简介

**曼哈顿图**(Manhattan Plot),因其形似曼哈顿摩天大楼,故俗称为曼哈顿图。本质上是散点图,一般用于展示大量非零的波动数据,y 轴高点显示出具有强相关性的位点,最早应用于全基因组关联分析(GWAS)研究中,可以一目了然地看基因的频率、分布。

适用场景

曼哈顿图主要用于全局展示数据全貌,快速找到目标位点,同时可以知道目标位点的具体位置,显著性。

优势:曼哈顿图即展示数据全貌,又能快速找到目标基因或 OTU,同时可知目标的具体位置和分类、显著程度等信息。

缺点:适用面较窄,一般用于基因相关的学科研究。

图例

  1. 展示基因组中与某种表型显著相关的 SNP 位点或基因型信息时,可以利用曼哈顿图进行较为直观的展示。

  1. 在对染色体绘制负对数 P 值的分布图时,可以利用曼哈顿图进行较为直观的展示。

数字孪生大屏应用案例

目前,我们山海鲸可视化资源中心提供了丰富的数字孪生大屏案例,在网页上就可以快速体验大屏。

  1. 网络信息链路拓扑监控

  1. 智慧风电可视化

  1. 智慧水闸可视化大屏

相关图表

散点图

堆叠瀑布图

变化瀑布图

组成瀑布图

参考资料

  1. https://figshare.com/articles/figure/A_genome_wide_Manhattan_plot_of_GWAS_in_a_comparison_of_AERD_with_NC/1278537/1
  2. https://zhuanlan.zhihu.com/p/538332918
  3. https://www.jianshu.com/p/41effb13124c